Eläinakupunktio perustuu samaan itämaiseen filosofiaan ja menetelmiin kun ihmisille annettava akupunktio. Akupunktiota on käytetty niin ihmisten kuin eläintenkin hoitoon ainakin 2000 vuoden ajan. Vanhan kiinalaisen lääketiteteellisen filosofian mukaan sairaus on seurausta energian epätasapainosta elimistössä. Akupunktion uskotaan tasapainottavan tätä energiaa ja täten auttavan elimistöä paranemaan.

Akupunktio vaikuttaa tuki- ja liikuntaelimistöön, hormonaaliseen järjestelmään sekä sydän- ja verisuonielimistöön. Sairaudesta ja käytettävistä pisteistä riippuen akupunktio nopeuttaa verenkiertoa ja aiheuttaa elimistön kemiallisten yhdisteiden vapautumisen mukaan lukien elimistön omat kipua lieventävät hormoonit kuten endorfiinit. Akupunkiolla on myös lihaksia rentouttava vaikutus. Akupunktion tiedetään myös stimulovan hermostoa ja elimistön omaa puolustusjärjestelmää.